El Fondo de Desarrollo de la Educación Superior, FODESEP, es una entidad de economía mixta, de derecho privado, sin ánimo de lucro, de interés social, organizada bajo los principios de la economía solidaria, creado por la ley 30 de 1992, y reglamentado por el Decreto 2905 de 1994. Se rige por las anteriores disposiciones y por el acuerdo de voluntades contenido en el Estatuto, adoptado por los representantes del Estado y las Instituciones de Educación Superior afiliadas.

Fue creado para promover el financiamiento de proyectos específicos, plantear y promover programas y proyectos económicos en beneficio de las Instituciones de Educación Superior tanto públicas como privadas que deseen afiliarse al mismo y que se convierten en sus aportantes y gestoras.La representación del Estado en FODESEP está en cabeza del Ministerio de Educación Nacional –MEN-, Instituto Colombiano para el Fomento de la Educación Superior –ICFES- y el Instituto Colombiano de Crédito Educativo y Estudios Técnicos en el Exterior- ICETEX-,quienes con su participación, contribuyen al desarrollo de la entidad para que se constituya en un instrumento de fomento a la educación superior.

La Supervisión del Fondo la efectúa la Superintendencia de la Economía Solidaria, el Control Fiscal lo ejerce la Contraloría General de la República y el Control de Tutela el Ministerio de Educación Nacional, toda vez que FODESEP se encuentra vinculado al mismo. La dirección general y la administración, están a cargo de la Asamblea General, el Consejo de Administración y la Gerencia General. FODESEP además cuenta con una Junta de Vigilancia que ejerce control social y una Revisoría Fiscal.